1、供氧不同

         厌氧生物处理不需供氧，厌氧生物处理（Anaerobic Process）是在厌氧条件下，形成了厌氧微生物所需要的营养条件和环境条件，通过厌氧菌和兼性菌代谢作用，对有机物进行生化降解的过程。

         好氧生物处理利用好氧微生物（包括兼性微生物）在有氧气存在的条件下进行生物代谢以降解有机物，使其稳定、无害化的处理方法。

         2、终级产物不同

         厌氧生物处理终级产物为热值很高的甲烷气体，可用作清洁能源；

         好氧生物处理经过一系列的生化反应，逐级释放能量，以低能位的无机物稳定下来，达到无害化的要求，以便返回自然环境或进一步处理。
        

  3、适用范围不同

        厌氧生物处理特别适宜于处理城市污水处理厂的污泥和高浓度有机工业废水。好氧生物处理效率高，应用广泛，已成为城市污水处理的主要方法。但好氧生物处理的能耗较高，剩余污泥量较多，特别不适宜处理高浓度有机废水和污泥。